宏转录组测序
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案例解析
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Q&A
①技术介绍
宏转录组学是一门在整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生物全基因组转录情况以及转录调控规律的学科。宏转录组测序,可原位研究特定生境特定时空下微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。结合理化因素的检测,宏转录组可研究多样本间由于理化等指标的差异,时空上不同微生物群落间活跃成分组成的差异分析。
②技术路线
③技术参数
样本要求 | 测序策略 | 交付周期 |
样品类型:环境微生物RNA样品 样品浓度:≥100ng/μl 样品总量:≥4μg 样品纯度:OD260/280为1.8~2.2,OD260/230为1.8~2.2;28S: 18S≥1;RIN≥7 |
测序模式:lllumina/MGI PE150 测序深度:6-12G clean data |
45天 |
④产品优势
a.技术优势:采用官方去核糖体试剂盒,可以有效去除rRNA,大大提高有效数据利用率;
b.个性化解决方案:除常规分析外,可给予多项高级分析,为您的项目给予最佳解决方案。